התכנית החינוכית של תוהו נועדה לתת לחניכיה את רוחב היריעה ועומק המחשבה הנדרש כדי לבנות אדם שלם בעל יכולות להוביל בחברה. תכנית הלימודים מעמיקה ביותר ומנצלת את העובדה שמדובר בתכנית ארבע שנתית פנימייתית הוליסטית ולכן יש בידינו את האפשרות להרחיב ולהעמיק מעבר למה שמקובל בתיכון או פנימייה רגילה. התכנית החינוכית כוללת שלושה נדבכים מרכזיים שהחניך רוכש במהלך שנותיו בתיכון.

׳תיכון תוהו׳ מהווה את השלב הראשון במסלול תוהו שהוא מסלול עשר שנתי המלווה את החניכים מכתה ט ועד לכניסתם לאקדמיה ולתעשייה.

התיכון עשיר במשאבים וכולל שעות הוראה ולמידה מוגברות, משאבי למידה רבים, יחס חניכה גבוה וצוות הוראה איכותי רב תחומי ומגוון. התיכון פועל על פי העקרונות המנחים של המשכיות, לא כמו כולם, גילוי, Priceless.

בכל שנתון בתיכון תוהו לומדים כ-20 בנות ובנים מכל רחבי הארץ, מסורתיים, דתיים וחילונים, בעלי יכולות וכישרונות מגוונים המגויסים בתהליך איתור ומיון ייחודי ומוקפד. כל בוגרי התיכון מכוונים לבגרות מדעית מצטיינת ולאחריות חברתית ואישית גבוהה.